前面我们谈到，转基因食品改变的是食品的基因，不是改变人的基因，吃转基因食品和吃其他的食品一样，是不会改变人的基因的。那么转基因食品是不是就完全不存在健康风险呢？
任何食品都有可能带来健康风险，没有人愚蠢到会认为转基因食品就是例外，所以科学机构、科学家会经常发表报告、发表论文，评估、研究转基因食品的风险。每一种转基因食品在上市之前，都要对它的安全性进行评估。
转基因食品里头的基因本身不会带来健康风险，但是基因是要生产蛋白质的，如果生产的是对人体有毒的蛋白质，当然会对人体健康造成伤害。但是科学家又不是恐怖分子，不会把有毒蛋白的基因转入到食品当中的，所以这点是不用担心的。
转基因作物往往是过量地制造某一种外源的蛋白质，即使这种蛋白质是无毒的，会不会导致过敏呢？这才是更值得关注的问题。如果一种蛋白质不会导致过敏，那么制造它的转基因食品也不会导致过敏；那些会让某一些人过敏的蛋白质如果被转入到作物中，用它做食品就有导致过敏的可能性。研究人员在研究转基因作物的时候，已经充分考虑到这个问题。过敏症的患者90%以上是对牛奶、干果、蛋、海产品、小麦、豆类这几大类食品过敏，因此来自这些食物的基因将不被采用。
已知的过敏源大约有500多种，把转基因作物制造出来的新的蛋白质的化学结构和成分，与已知的这些过敏源一一做比较，如果发现具有一定的相似性，那么这种蛋白质基因也会被放弃。大部分的过敏源都难以消化，因此转基因产生的新蛋白质还要检测是不是能够快速地被消化。如果不能被快速地消化，这种转基因食品也不能供食用。在经过了严格的检测和管理之后，含有过敏原的转基因食品能够上市的可能性很小。如果不慎上市了，也还可以补救，不会出现灾难。转基因食品在世界范围内被吃了快20年了，到现在还没有发现有人吃了它过敏，这说明我们这一套检测的方法是很可靠的。
所以，不能否认转基因食品是有风险的，但是风险并不等于实际的危险，转基因作物的风险是可以控制的。为了避免健康方面的风险，对人体有害的蛋白质和已知的过敏原不会被用来制造转基因作物。在转基因食品上市之前，都按要求做过实验检测它的安全性。一般是先做生化实验检测，看看转基因作物和同类的作物相比，在成分方面发生了什么变化，这些变化是否有可能对人体产生危害；然后再做动物实验，看看转基因食品是否会对动物的健康产生不利的影响。这其实是检测食品安全性的常规做法，不只是对转基因食品才这么做，对非转基因的食品也这么做。如果不信任这一常规的方法，那么是不是也应该怀疑其他食物的安全性呢？
有人说：“对转基因食品还是需要慎重”。这是一句正确的废话，因为对任何食品都需要慎重，不管是转基因的还是非转基因的。这些人实际上是想说，必须证明转基因食品“绝对”无害，排除转基因食品有害的可能性，才算得上是慎重。要完全排除一种可能性，是几乎不可能的事。所谓“天然”的食品同样不可能排除有害的可能性：很多所谓的“天然”食品实际上对人体是有害的，比如说，可能导致过敏、可能增加心血管疾病的风险、可能含有致癌物等等。我们所能做的，只是问：有没有合理的理由和确切的证据，表明市场上的转基因食品要比同类的非转基因食品更有害健康呢？答案是：没有。
事实上，已经上市的转基因食品不仅是安全的，而且往往要比同类非转基因食品更安全。种植抗虫害的转基因作物能不用或少用农药，因此减少或消除了农药对食品的污染。大家知道，农药残余过高一直是现在食品安全的大问题。抗病害转基因作物能抵抗病菌的感染，从而减少了食物中病菌毒素的含量，这对健康也是很有利的。转基因食品采用的技术更精确，受到的管理更严格，风险比同类的非转基因食品更低。很多非转基因食品没有做过任何安全性检测就上市了，大家不去担心，对经过安全性检测才上市的转基因食品，为什么反而要害怕呢？
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